Байкальская нерпа выступает видом-индикатором состояния всей байкальской экосистемы. С ведущими научными организациями страны осуществляется комплексная программа мониторинга вида, включающая ежегодные авиаучёты с использованием БПЛА на архипелаге Ушканьи острова. По данным учёта, проведённого Байкальским филиалом ФГБНУ «ВНИРО», общая численность популяции байкальских тюленей составляет 148,2 тыс. особей, а её состояние в целом оценивается как стабильное.
По словам директора Заповедного Подлеморья Михаила Овдина, данные за 2013-2026 годы показывают устойчивое многократное снижение количества экологических правонарушений и, что особенно значимо, практически полное прекращение случаев, влекущих возбуждение уголовных дел. Для патрулирования ООПТ и выявления нарушений установленного режима применяются, в том числе, беспилотные летательные аппараты. Организовано круглосуточное видеонаблюдение за акваторией Чивыркуйского залива. В местах, где вероятность браконьерства наиболее высока, устанавливаются фотоловушки, фиксирующие факты незаконной деятельности на ООПТ.
«Акватория озера Байкал в границах Баргузинского заповедника и Забайкальского национального парка относится к числу наиболее продуктивных участков воспроизводства водных биологических ресурсов озера. Поэтому организация эффективной охраны объектов животного мира рассматривается как одна из приоритетных задач», – отметил Михаил Овдин.
Ежегодно Байкальский регион принимает более 2,5 миллиона туристов. Рост антропогенной нагрузки требует системных природоохранных мер. Внедряются методики расчёта рекреационной ёмкости заповедных территорий, обустроено более 100 километров экотроп, запущены системы цифрового учёта и квотирования посещаемости.
Общая площадь федеральных ООПТ на Байкальской природной территории составляет 4,6 миллиона гектаров. Именно на Байкале был создан первый в России заповедник – Баргузинский. В границах Байкало-Ленского заповедника берёт исток река Лена. Байкальский заповедник защищает реликтовые болота и темнохвойные леса хребта Хамар‑Дабан.
Прибайкальский национальный парк является самым протяжённым в России, его территория занимает 490 км вдоль побережья Байкала. Забайкальский национальный парк защищает крупнейшее лежбище байкальской нерпы. А Тункинский национальный парк сохраняет горные ландшафты Восточных Саян.
